تصفيات أفريقيا المؤهلة لكأس العالم 2010 لها مرحلتين :
المرحلة الأولى : تتكون من 48 منتخب ينقسمو إلى أربع مجموعات ( A , B , C , D ) من 12 مجموعة وكل مجموعة من الـ 12 بها 4 منتخبات ماعدا مجموعة واحدة بها 3 منتخبات وذلك بعد انسحاب منتخب اريتريا ,, وهذه المنتخبات يلعبو مباريات ذهاب وعودة ,, وكل منتخب متصدر مجموعته حتى نهاية الجولات بالإضافة إلى أفضل ثماني منتخبات يتأهلو مباشرة إلى المرحلة الثانية من تصفيات أفريقيا المؤهلة لكأس العالم 2010 .
المرحلة الثانية : تتكون من 20 منتخب كل ينقسمو إلى 5 مجموعات مباريات ذهاب وعودة ,, والمنتخبات متصدرة المجموعات الخمس تتأهل مباشرة لمونديال كأس العالم 2010 ,, هذا بالإضافة للمنتخب صاحب استضافة المونديال وهو جنوب أفريقيا الذي تأهل مباشرة لمنافسات كأس العالم 2010